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物理性污染的危害
物理性污染包括热污染和放射性污染。大量含热废水持续排入水体可使水温升高，造成水环境发生一系列物理、化学和生物学变化。通常水中的化学反应速度随温度升高而加快，水温每升高10℃，
化学反应的速率约增加一倍，水中有毒物质、重金属离子等对水生动物的毒性也随之增强。
中放射性物质可通过饮水或受污染的食物进入机体。人体接触到含放射性物质的水可引起外照射，而饮水或食品受放射性污染后可造成内照射，导致某些疾病的发生率增加并可能诱发人群恶性肿瘤发生率增高，并可影响后代的健康。
此外，非溶解性悬浮物对水体的污染，可影响水的感官性状，并对水生动植物的生态环境产生有害影响。
化学性污染的危害
受工业废水污染后，水体中各种有毒化学物质如汞、砷、铬、酚、氰化物、多氯联苯及农药等通过饮水或食物链传递使人体发生急、慢性中毒。
生物性污染的危害
受生物性致病因子污染后，居民常通过饮用、接触等途径引起介水传染病的爆发流行，对人体健康造成危害。最常见的疾病包括霍乱、伤寒、痢疾、甲型病毒性肝炎、隐孢子虫病等肠道传染病及血吸虫病、贾第虫病等寄生虫病。
